...
Для повышения гибкости обфускации рекомендуется устанавливать /CFO совместно вместе с опцией /XML, это позволит использовать включения и/или исключения обфускации графа потока.
Пример:
CodeProtectCodeObfuscator.exe /GS3S /CFO=50 /XML=config.gpp MyProg.dll
...